Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP50Q70EL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms