Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAXIP1Q6ZW49 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms