Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
UBR3Q6ZT12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBR3Q6ZT12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR3Q6ZT12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms