Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM43Q6ZSC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM43Q6ZSC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM43Q6ZSC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms