Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms