Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD109Q6YHK3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CD109Q6YHK3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms