Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOSTDC1Q6X4U4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms