Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCBE1Q6UXH8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms