Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRSAM1Q6UWE0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRSAM1Q6UWE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms