Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZBED9Q6R2W3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms