Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDF2Q6PJF5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms