Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms