Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1BQ659C4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms