Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1DP3Q658K8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms