Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD7Q5XG87 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD7Q5XG87 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPD7Q5XG87 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms