Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SUSD4Q5VX71 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms