Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SFMBT2Q5VUG0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms