Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF38BQ5VTL8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms