Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFI1BQ5VTD9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GFI1BQ5VTD9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms