Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GKAP1Q5VSY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms