Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HES3Q5TGS1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms