Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM78Q5T7P6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms