Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRIF1Q5T3J3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIF1Q5T3J3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms