Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERM1Q5SV97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms