Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HP1BP3Q5SSJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HP1BP3Q5SSJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms