Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPANXN4Q5MJ08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXN4Q5MJ08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms