Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCID2Q5JVF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms