Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD3Q5JSP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD3Q5JSP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms