Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A13Q5J8X5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A13Q5J8X5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms