Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3AQ59EK9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3AQ59EK9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms