Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSD17B12Q53GQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HSD17B12Q53GQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms