Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCD4Q53EL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms