Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBK1Q52WX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBK1Q52WX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBK1Q52WX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBK1Q52WX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBK1Q52WX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms