Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAL1Q4LDG9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms