Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN20Q4JDL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN20Q4JDL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN20Q4JDL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.6 ms