Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNF212Q495C1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms