Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC153Q494R4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms