Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPTABQ3T906 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GNPTABQ3T906 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms