Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM30BQ3MIR4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM30BQ3MIR4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms