Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TWISTNBQ3B726 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TWISTNBQ3B726 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms