Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VWC2Q2TAL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms