Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA3Q16787 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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