Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK5Q16478 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms