Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NTRK3Q16288 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK3Q16288 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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