Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP3Q15836 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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