Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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