Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC23BQ15437 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC23BQ15437 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC23BQ15437 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC23BQ15437 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC23BQ15437 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC23BQ15437 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC23BQ15437 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC23BQ15437 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SEC23BQ15437 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEC23BQ15437 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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