Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP1Q15431 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP1Q15431 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP1Q15431 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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