Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC41Q15345 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC41Q15345 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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