Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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RCN1Q15293 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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